I microrganismi, soprattutto batteri e funghi, in quanto decompositori, costituiscono l'anello conclusivo delle reti alimentari e sono quindi indispensabili per il ciclo della materia, poiché mineralizzano le sostanze organiche. Molti microrganismi sono anche implicati in relazioni simbiotiche, quali i licheni (alghe-funghi) o le micorize (funghi-radici), fondamentali per la formazione dei suoli o per la vita delle piante. Altri, invece, costituiscono il plancton, alimento base della fauna acquatica.

Il progetto prevede la raccolta, l'osservazione/fotografia al microscopio ottico e la classificazione di campioni dei microrganismi presenti in acque stagnanti e correnti, suoli, e vegetazione.